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苹果全基因组PAL基因家族成员的鉴定及表达分析

作者: 张丽之 樊胜 安娜 左希亚 高彩 张东 韩明玉

关键词: 苹果 PAL基因家族 生物信息学 系统进化分析 基因表达

摘要:根据金冠苹果参考基因组,利用BLAST在线网站鉴定得到苹果基因组中共8个PAL基因,所有Md-PAL蛋白都含有MIO保守结构域(Ala-Gly-Ser).分组鉴定和进化树分析结果显示,MdPAL蛋白可以被分为3组,分子量在47.713~81.748 ku,等电点在5.44~6.39,进化关系较近的成员拥有相似的基因结构和蛋白保守基序分布.利用GEO数据库和实时荧光定量PCR的方法检测苹果长富2号品种中PAL基因在不同组织器官及5个不同果实发育阶段的表达情况.不同组织器官表达结果表明,MdPAL2、MdPAL3/4/6/7、Md-PAL8在叶中表达最高,而MdPAL1和MdPAL5在花中表达最高,表达模式存在多样性.不同果实发育阶段表达结果发现,MdPAL表达规律不同,所有MdPAL在幼果发育期或果实成熟期显著升高(除MdPAL1外),暗示其在果实发育和成熟过程具有重要作用.


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