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大耳白兔MSTN基因SNPs位点筛查及生物信息学分析

作者: 任卫合 任稳稳 马博妍 高成宏 李宏旭 刘丽霞 曹忻 张丽

关键词: 大耳白兔 MSTN基因 单核苷酸多态性 生物信息学

摘要:为探明大耳白兔MSTN基因与生长发育及肉质性状的关联性,以大耳白兔为试验对象,构建DNA混合池,采用PCR扩增和直接测序技术对该基因进行单核苷酸多态性(SNP)筛查,从而筛选出对大耳白兔肉质性状有显著影响的SNP位点,利用生物信息学方法从分子水平对大耳白兔MSTN基因编码的蛋白质进行功能预测和同源性分析.结果显示:大耳白兔MSTN基因编码区序列全长1128 bp,编码375个氨基酸,是一种不稳定的水溶性蛋白;蛋白质分子量42.8 ku,理论等电点为6.97;蛋白质二、三级结构均为混合型,无规则卷曲所占比例最高.在扩增区域的非编码区发现1个SNP位点,该突变不影响编码氨基酸的改变.同源性分析表明,大耳白兔MSTN基因与普通家兔相似度为100%,与家猫相似度较高,亲缘关系很近.


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